超大型计算机无法派上用场，这个时候只能由研究员们进行判断。
以天井亚雄为代表的支持继续实验的派系表示御坂妹妹们就是为了实验而生的小白鼠, 在树状图设计者重组之前，他们应该继续这个极为耗费时常的实验——毕竟一方通行已经耽误了好几个月的进度。
芳川桔梗虽然想要将御坂妹妹们当做人类来保护, 奈何她们本人并无感情认知。
布束砥信试图为御坂妹妹们植入感情装置, 却被不知名的司令塔拦截信息, 自身难保。
各大相关实验所陷入混乱之际，天井亚雄等人强行重启了实验。
不愿意再杀御坂妹妹的一方通行简直神烦。
“我认为这种实验没有继续进行的必要了。”
“那么御坂便没有继续生存的价值。”
将枪口对准了自己的御坂妹妹按照实验员的要求，以自杀来威胁着站立在学园都市巅峰的白发少年。
而这一幕，恰巧被正在偷偷联网帮助初春饰利白井黑子查找犯罪监控、想要给小伙伴们一个惊喜的御坂美琴本人通过实验所监控的镜头撞见了。
见到“另一个自己”的感觉是怎样的？
世界最真实的黑暗面在曾经一无所知的御坂美琴面前铺展开来。
小伙伴语焉不详的模样突然闪现在眼前。
【有些事情我们正在处理……总之，美琴，如果你遇到了困难，记得一定要联系我。】
御坂美琴直接去找了一方通行——她是知道齐木悠真的住址的。
敲开门的一瞬间，白发少年露出了极为不耐烦的表情：“又来？我说过不会再做那种无意义的实验了。”
“一方通行。”穿着常盘台制服的茶发少女视线深沉，“我是御坂美琴。”
“我当然知道你……”一方通行顿住了话语，认真的打量了一番面前有些紧张的女孩儿，唇角勾起了一个饶有兴致充满了战斗欲的笑容，“你是level5的原版？”
“你果然知道。”御坂美琴抿了抿唇，“也就是说，悠真也知道是吗？”
刚想要开打的一方通行收起了将第三名超电磁炮摁在地上摩擦的战斗欲。
“啧，你认识那家伙？”
“他曾经和我说过，你们正在处理一些事情。当时我还不明白。”