造物主提高了矩阵特工们的警戒，而先知也通过锡安里的某位十分信任她的人吩咐了一些事情。
于是，一个惊人的消息在人类抵抗军内部流传：“世间出现了另一个可怕的势力……他们摧毁了洛杉机，杀死近百万人……他们很有可能是机械的反叛者。比起矩阵，他们对待人类的行为更为残酷，他们是为了灭绝人类而来的。我希望你们帮我寻找到他们……”——先知就是这么说的。
“什么？洛杉机居然，我们近百万同胞都……”锡安的人们对此也感到一阵恶寒。因为消息是从那个人口里传出的，而这又是先知的话，所以他们并没有怀疑这消息的真实性。
一时间，锡安战船四处。他们在相信了先知的话之后，也都试图找到那个毁灭洛杉矶的人。至于找到那个连洛杉机都能干掉的家伙之后怎么办，他们却是没有太多的考虑。
锡安的人干劲十足，他们却是没有想过自己才是极为弱小的一方。
世界的轨迹就在元皓的一次大行动之下被波动了一下，至于这个轨迹会不会因此而产生什么影响却是谁也说不准的事情。
而对于这一系列的变化，元皓自己根本就没有什么印象。在大海之中沉闷的航行，元皓花了足足一个月的时间才将这一百多万人从北美大陆的西海岸运到位于东海岸的基地之中。
此时，基地的地下已经被开辟出了一个更为巨大的空间，在这样的空间里，无数类似于生物发电厂的装置存在着。
元皓让运输水母们将运输舰里的胞舱一个接着一个放入其中，然后重新将他们的意识通通接驳起来，并重新编织一段记忆，将他们接入属于自己的矩阵之中。
一切似乎都没有改变，对于那些沉迷于睡梦之中的人是这样的。
而对于另外一些人来说，一丝丝怪异的感觉在他们的心底冒起。他们已经隐约感受到这个世界的古怪了。
“这个世界究竟是怎么了？”他们好奇的想着。
就在他们对此有所怀疑的时候，一条古怪的消息出现在他们的手机或是电脑上：“想知道生命的意义么？想真正的活着么？”
“额……这样的说法似乎很有点！”在心怀忐忑的时候，总有人对这样的说法产生共鸣，也有人对此好奇的很，于是有人便作死的点了进去，被传送到了另外一个地方。
那是一个名为虚数空间的存在，同样也是元皓所构建的矩阵的一部分。只是和安定祥和的现代都市不同，虚数空间却是相当残酷的。
那里就是一个兵营，是人们学会服从，认知真实的地方。在元皓最初的设想中，他就是要利用这个类似于这个主神空间的存在，将对“现实”世界有所怀疑的人们抽调出来，一步一步的引导他们如何接受世界已经被玩坏，人类已经不是主角的现实。
能够接受的人，在虚数空间“存活”下来的人将成为元皓的部下，来到真正的现实世界，而来无法接受这一切的人，在虚数空间屡屡失败，最后战死的家伙，则会被虚数空间所淘汰，在经过一番记忆操作之后被传送回那个安定的现实世界，继续过着醉生梦死的混沌生活。
这听起来似乎是更好的选择，但元皓在三个月后面对初步经过自己考核成功来到这令人感到冰冷而绝望的世界的时候是这么和他们说的：“现实是令人厌恶的，也许你们这里还有人怀恋那里的平静而美好。
人是通过感觉来认知世界的，当所有的感觉都被误导之后，虚幻和真实似乎也没有太大的区别。但是，你们这一代已是这样了，你们愿意你们之后的人，你们的孩子们，你们孩子的孩子们也是这样么？
路是人走出来的，人类的伟大在于我们懂得创造。似的，现在很困难，很绝望，但是再怎么困难绝望，我们有我们人类的祖先所面临的情况困难绝望么？
拿起祖先的勇气吧！我们必须为我们后辈开辟一条道路，一个族群的生存之道。
如果你不想人类继续作为水果一样的存在，那你们就必须让人类重新回到主角的位置上。人是统御万物的，而不是像今天这样成为机械的玩偶！”
一席话，元皓所的这些平均年纪不到三十的青年心里充满了干劲。在挑选从者的最初，元皓便有意将范围圈定于三十之下。
在元皓看来这一年龄段的人不但心智趋于成熟，而且还拥有一定的可塑性，拥有最后的热血。